Institut Václava Klause, v němž chce odcházející prezident působit po svém odchodu z Hradu, vydal jako svou první publikaci sborník textů o Klausově amnestii. Publikace nazvaná Spor o amnestii obsahuje mimo jiné text kontroverzního rozhodnutí, Klausova veřejná vyjádření k amnestii a reakce politiků na ní.
Klausův institut do knihy vybral také některé filosofické a právní úvahy o amnestii i dopisy občanů prezidentovi. Podle Klausových spolupracovníků se jedná o dopisy lidí, kterých se amnestie "přímo či nepřímo dotkla, ale i o ty, kteří pouze cítili potřebu prezidenta podpořit, neboť nesouhlasí s vzniklou mediální štvanicí a povrchním zneužíváním ústavního institutu amnestie".
Institut Václava Klause publikaci vydal ve spolupráci s prezidentovi názorově blízkým Centrem pro ekonomiku a politiku (CEP). Ten vydává podobných sborníků několik v roce. V ediční řadě navazuje Spor o amnestii na publikaci Břidlicový plyn - Energetická revoluce.
Klaus, který v prezidentském úřadu skončí 7. března, vyhlásil amnestii na Nový rok u příležitosti dvacátého výročí vzniku České republiky. Prezident prominul nevykonané nepodmíněné tresty odnětí svobody, které byly uloženy do konce loňského roku a nepřevyšují jeden rok v cele. Amnestie se týkala také trestů odnětí svobody u lidí, kterým letos bude 75 let a délka jejich trestu nepřesáhla deset let.
Největší kontroverze ale vyvolalo ustanovení, podle nějž Klaus zastavil pravomocně neskončené trestní stíhání, od jehož zahájení k 1. lednu uplynulo více než osm let. Nařízení se dotýká trestných činů se sazbou nepřevyšující desetileté odnětí svobody. Ukončit by se kvůli tomu mohlo až osmnáct velkých hospodářských kauz spadajících pod vrchní státní zastupitelství. Podle návrhu Městského soudu v Praze je celá amnestie v rozporu s ústavou, pokud ji předem neprojednala vláda. Zabývat by se tím měl Ústavní soud, podle většiny expertů ale stížnost nemá šanci na úspěch.
